ERP是一种先进的管理理念，好的ERP系统体现了一种科学、规范、细化的管理方法。因此，决策者在选择ERP的时候，实际上也就在企业内引入了一种全新的规范管理方法。另一方面，企业管理者在多年的经营管理中已经形成了很多适合行业特色、本企业自身特色和本企业领导者特色的管理方法，这些方法符合企业自身的文化特色，在业务经营中发挥着很重要的作用。

遵循规范、科学的ERP还是坚持灵活的企业特色成为决策者必须解决的问题，通常有三种答案：

完全采用ERP先进方法，牺牲企业自身特色；

遵循企业管理特色，对ERP进行“大手术”；

既采用ERP的先进方法，又满足企业管理特色。

采用方法1的优点在于实施周期短，系统功能完善；缺点在于业务人员适应周期长。方法2则相反，实施周期长，系统出错率高；优点在于业务人员适应周期短。方法3是一种折中的方法，关键在于把握其中的度。通常，成熟的ERP产品仅允许不超过20%的定制开发工作量，如何利用好这20%的特色是企业进行ERP实施前要仔细规划的问题。

IT应用是信息系统中最难、最具挑战性、最关键的部分，而ERP软件系统又是IT应用中最重要，也是最核心的一环。在选择既采用ERP的先进方法，又满足企业管理特色的选项时，在ERP实施过程中，最难驾驭的就是“企业特色功能”，如果产品功能经常伸缩修改，项目需要的资源(时间、人力、资金)就处于一个不确定状态，项目的组织就难以做到计划性和有序性。在给定资源的情况下只有完成一定的功能才是有保障的，功能无限延长，项目必定无法实施下去。