ERP快速实施法有很多潜在的弊端。如果ERP项目的目标是尽早上线，那么快速实施法就有点像篮球运动的扣篮动作。在这个快速实施的过程中，企业稍不留心就容易带来很多问题，导致用户们对新ERP系统的接受度很低。

快速实施法也不一定真的能够帮企业节省实施成本。在快速实施方式下，很多原本应该由企业员工完成的实施工作，很有可能都让ERP外部顾问给代劳了。这样做的后果，会很容易让快速实施法的实施费用比其他实施方法还要高。另外，如果砍掉一些定制软件（尤其是工具软件）的开发工作，实际上会加大企业方实施人员的工作量。举例来说，本来通过工具软件可以很快地完成数据的转换与导入，而现在只能让大家手工处理这些庞大的数据输入工作，或者是雇用一些临时的数据输入人员来做这件事情。对于ERP软件的修改也是同样的道理，有时候从业务处理的角度来看，适当地修改一下ERP软件是非常合理的。

进一步说，快速实施法的另一个负面影响，是会大大减少企业方项目小组人员在项目上的参与。这样的话，大家接受的软件知识培训就会大幅减少，来自于业务部门的建议也非常少。由于对ERP项目缺乏足够的了解，导致很多员工会抵制ERP项目所带来的变革。要想消除这些负面影响，企业不但要投入时间，还要投入足够的资金才能做好。

最后一点，企业请很多外部顾问来帮忙实施ERP的目的，就是希望能够加快实施速度。然而如果因为某些原因，导致快速实施法并没有达到缩短ERP实施周期的目的，那么企业想节省实施费用的意图就只能是竹篮打水一场空，甚至会让企业支付更高的实施成本。